SSC緩沖液使分子生物學中標準的印記和雜交處理溶液,在用于各種雜交實驗達到變性和清洗的目的,主要成為氯化鈉和檸檬酸鈉。SSC緩沖液中檸檬酸鈉起緩沖作用,鹽粒子中和核酸主鏈上的負電荷,使其呈電中性,這樣可以使探針和靶序列的結合比較容易進行。也用于SD-PAGE電泳分離膠配制。用于核酸雜交,不同濃度作用不同,常用2x及0.5x
2xSSC:高鹽洗膜,洗去部分非特異性結合的探針。0.5xSSC:低鹽洗膜,增加核酸鏈的嚴緊性,使得RNA/DNA之間的排斥力增加。